Антибиотики используются в широком спектре методов молекулярной биологии, включая молекулярное клонирование, и важны для лечения загрязнения микоплазмой клеточных культур. Они также могут быть использованы для максимального увеличения плазмиды путем снижения синтеза белка, в определенных обстоятельствах.
Цель этой статьи дать понятие о некоторых из основных антибиотиков, которые используются в молекулярной биологии, их механизмы, диапазон и рабочие концентрации. Я надеюсь, что вы найдете здесь полезную для себя информацию.
| Антибиотик | Класс | На кого действует | Механизм | Резистентность обеспечивается | Конц. (мкг / мл) |
|---|---|---|---|---|---|
| Сокращения: Fu = грибок; Гм (+/-) = грамм положительный / отрицательный; My = микоплазма; Ye = дрожжи | |||||
| Ампициллин (Ampicillin) | Бета-лактамы | Гм +, Гм- | Ингибирует транспепсидазу, необходимую для синтеза клеточной стенки | Бета-лактамазы. Расщепляет бета-лактамное кольцо ампициллина | 100-200 |
| Амфотерицин В (Amphotericin B) | Ye, Fu, My | Комплексы с холестерином, образуя поры, которые позволяют утечку глюкозы | 2.5 | ||
| Карбенициллин (Carbenicillin) | Бета-лактамы | Гм +, Гм- | Ингибирует транспепсидазу, необходимую для синтеза клеточной стенки | Что касается ампициллина, то карбенициллин расщепляется бета-лактамазой медленнее | 100 |
| Ципрофлоксацин (Ciprofloxacin) | Синтетические | Гм +, Гм-, My | Ингибирует бактериальную ДНК-гиразу и топоизомеразу IV | 5-25 | |
| Хлорамфеникол (Chloramphenicol) | Гм +, Гм- | Связывается с рибосомальной субъединицей 50S, предотвращая пептидилтрансферазу, необходимую для трансляции | Хлорамфениколацетилтрансфераза добавляет ацетильную группу от ACoA к хлорамфениколу, которая ее инактивирует. | 5-10 | |
| Эритромицин (Erythomycin) | макролид | Гм +, My | Похож на хлорамфеникол | ermC метилтрансфераза метилирует 23S рРНК, предотвращая связывание эритромицина с рибосомой | 100 |
| Канамицин (Kanamycin) | аминогликозид | Гм +, Гм-, My | Связывается с рибосомальной субъединицей 30S, блокирует комплекс инициации и вызывает мутации со сдвигом рамки и ингибирует трансляцию | Фосфотрансфераза канамицина влияет на АТФ-зависимое фосфорилирование гидроксильных остатков на канамицин | 100 |
| Гентамицин (Gentamycin) | аминогликозид | Гм +, Гм- | Похож на канамицин | Гентамицина ацетилтрансфераза: механизм, аналогичный хлорамфениколацетилтрансферазе | 25-50 |
| Неомицин (Neomycin) | аминогликозид | Гм +, Гм- | Похож на канамицин | Неомицин-фосфотрансфераза: механизм, сходный с канамицин-фосфотрансферазой | 25-50 |
| Нистатин (Nystatin) | Ye, Fu | Аналогичен амфотерицину В | 50 | ||
| Рифампицин (рифампин, rifampin) | Полусинтетические | Гм +, Гм- | Ингибирует ДНК-зависимую РНК-полимеразу, предотвращая транскрипцию | 50 | |
| Стрептомицин (Streptomycin) | аминогликозид | Гм +, Гм- | Связывается с 16S рибосомальной субъединицей, предотвращая инициацию трансляции | 3′-аденилтрансфераза стрептомицина переносит аденильную группу из АТФ на стрептомицин | 50 |
| Тетрациклин (Tetracycline) | Тетрациклины | Гм +, Гм- | Prevetns аминоацильная тРНК от связывания с 30S субъединицей | Ген TerR-TN10 кодирует белок внутренней мембраны, который выкачивает тетрациклин из клетки. | |
Это далеко не исчерпывающий список всех антибиотиков, используемых в молекулярной биологии, поэтому если я пропустил антибиотик, который вы регулярно используете в своей работе, пожалуйста, оставьте комментарий, и я добавлю его в таблицу.
Важно, чтобы вы хранили свои антибиотики надлежащим образом, чтобы быть уверенным, что они работают правильно, когда вы будете их использовать.
При использовании антибиотиков в чашках петри, знаете ли вы, как долго вы можете их готовить, или же чашки, которые находились в ваших холодильных камерах в течение последних нескольких недель, все еще пригодны для использования?
Если вы планируете использовать ампициллин для селекции (например, при клонировании или очистке белков кишечной палочки), вам необходимо знать о нескольких ограничениях, которые могут повлиять на способ применения этого антибиотика.
Добавить комментарий